Enhancer i promotor
Što je Enhancer?
Definicija pojačivača:
Pojačivač je kratki komad ili slijed DNK koji djeluje na poboljšanje ili ubrzanje brzine genetske transkripcije. Pojačivač se također često naziva cis-regulatorni element i iznosi između 20 i 400 baznih parova DNA veličine.
Mjesto:
Pojačivač se može nalaziti uzvodno ili nizvodno od određenog gena i može biti u istoj ili različitoj orijentaciji u usporedbi s genom koji se transkribira. Pojačivač ne mora biti blizu mjesta inicijacije transkripcije kako bi funkcionirala. Enhancers su prisutni i funkcioniraju u obje prokariotske stanice i u eukariotskim stanicama. Enhancers se mogu naći na intronima i eksonima i mogu djelovati na gene različitih kromosoma.
Funkcija:
Faktor transkripcije pridaje se pojačivaču kako bi stimulirao transkripciju gena. Enhancers, zapravo, ne djeluju izravno na promotore, već prvo moraju biti povezani s faktorima transkripcije. Enhancers mogu biti tisuće baze daleko od mjesta za pokretanje transkripcije. To je moguće zbog funkcioniranja pojačivača. Faktori transkripcije najprije se vežu na pojačivač. Tada protein DNA savijanja donosi pojačivač bliže promotoru u procesu koji se naziva DNA petlja. Enhancers tako poboljšavaju ili ubrzavaju brzinu transkripcije dovođenjem transkripcijskih aktera bliže promotoru. Enhancers također mogu regulirati više od jednog gena bez obzira na orijentaciju u odnosu na gene ili gene. Enhancers također su važan genetski element u razvoju, jer oni mogu pomoći u poboljšanju aktivacije transkripcije u stanicama.
Važnost:
Određeni pojačivači mogu igrati ulogu u ljudskoj bolesti, a istraživanje sugerira da cis regulatori mogu doista povećati rizik od bolesti poput dijabetesa tipa 2, kardiovaskularnih bolesti i raka debelog crijeva.
Primjeri Enhancer:
Primjer otkrivenog promotora gena je HACNS1, za koju se smatra da ima ulogu u razvoju ljudskog palca. Drugi primjer pojačivača je proksimalni pojačivač epiblasta (PEE), koji je važan pojačivač tijekom razvoja tijela kralježnjaka.
Što je Promotor?
Definicija promotora:
Promotori su dijelovi DNA sekvenci koji ukazuju na to gdje počinje transkripcija DNA RNA polimerazom. Promotori su uključeni u pokretanje ili pokretanje genetske transkripcije jer određuju koji će DNA sekvencija biti transkribirana (tj. Koji je lanac osjetilni lanac) i u kojem smjeru će doći do transkripcije.
Mjesto:
Promotori se obično nalaze uzvodno od početka transkripcije na 5'endu gdje počinje transkripcija. Promotori moraju biti u položaju 5 u blizini gena koji treba prepisati. Život DNK odnosi se na DNA lanac koji završava na 5'-ugljiku. Promotori se nalaze u obje prokariotske stanice i eukariotske stanice.
Funkcija:
Promotori se vežu za enzim RNA polimeraze i na faktore transkripcije. Promotor inicira proces transkripcije interakcijom s RNA polimerazom i transkripcijskim faktorima. Enzim RNA polimeraze slabo se veže na sekvencu DNA i pomiče duž duljine dok se ne susreće promotor. U ovoj fazi, tada formira zatvoreni promotorski kompleks s promotorom. RNA polimeraza zatim nastavlja odvijati DNK pri inicijaciji transkripcije ili početnom mjestu da se formira otvoreni promotorski kompleks. Potom je pokrenuta transkripcija.
Važnost:
Neki genetski promotori mogu biti uključeni i uključeni u bolesti. Varijacije u promotorima mogu biti povezane s određenim bolestima kao što su beta-talasemija i astma.
Primjeri promotora:
Mnoge eukariotske stanice imaju važan dio promotora poznat kao TATA kutija, koji se može naći od 25 do 35 baze uzvodno od početne točke transkripcije. Otkriveno je nekoliko primjera promotora. Neki od njih su važni u razvoju raka. Na primjer, PEG-3 promotor i humana reverzna transkriptaza telomeraze (hTERT), koje se nalaze u stanicama raka.
Razlika između unapređivača i promotora?
Pojačivač je dio DNA koji pojačava transkripciju gena. Promotor je dio DNA koji djeluje za pokretanje ili početak transkripcije gena.
Pojačivač se veže s transkripcijskim faktorima dok se promotor veže s transkripcijskim faktorima i enzimom RNA polimeraze.
Pojačivač može biti uzvodno ili nizvodno od mjesta na kojem se pokreće transkripcija dok je promotor uvijek uzvodno od mjesta na kojem je inicirana transkripcija.
Poboljšivač ne mora biti blizu mjesta gdje se transkripcija pokreće dok promotor mora biti blizu mjesta na kojem je pokretanje transkripcije.
Poboljšivač radi na poboljšanju ili povećanju transkripcije dok promotor radi za pokretanje postupka transkripcije.
Smatra se da su pojačivači povezani s bolestima poput dijabetesa tipa 2, kardiovaskularnih bolesti i raka debelog crijeva. Smatra se da su promotori povezani s bolestima poput astme i beta-talasemije
Primjeri pojačivača uključuju HACNS1 i PEE. Primjeri promotora su PEG-3 promotor i humana reverzna transkriptaza telomeraze (hTERT).
Tablica uspoređuje poboljšatelja i promotora
Sažetak poboljšatelja vs. pokretač
- Pojačivač je sekvenca DNA koja funkcionira za poboljšanje transkripcije.
- Promotor je sekvenca DNA koja inicira proces transkripcije.
- Promotor mora biti blizu gena koji se transkribira, a pojačivač ne mora biti blizak genu od interesa.
- Oba promotora i pojačivači pomažu regulirati genetsku transkripciju.
- Enhancers i promotori mogu biti važni u bolesti.