SDS PAGE i Gel Electrophoresis

SDS PAGE vs Gel Electrophoresis

Elektroforeza se može koristiti za utvrđivanje mase obično za protein i deoksiribonukleinsku kiselinu (DNA). DNK, kada se uvodi u kemikalije, može ubrzati ili usporiti informacijski proces. DNK biljezi poznate mase koriste se za približavanje veličine predmeta koji putuju nakon završetka elektroforeze. Najvjerojatnije će elektroforeza biti najčešće korišten alat za molekularne biologe i biokemičare.

Postoje dvije vrste elektroforeze koje se uobičajeno koriste u ovom procesu. To su natrij dodecil sulfat poliakrilamid gel elektroforeza (SDS-PAGE) i nativne gel elektroforeze.

SDS-PAGE je neselektivna metoda gel elektroforeze koja se upotrebljava u područjima kao što su: biokemija, forenzika, biologija i genetika za odstranjivanje proteina iz njihove elektroforetske pokretljivosti. SDS je anionski surfaktant koji se može koristiti za pomoć u stanicama liziranja tijekom ekstrakcije DNA i za odvajanje proteina u SDS-PAGE. Tijekom elektroforeze, smjesa proteina prvo je ukapljena u otopini SDS. Zatim se primjenjuje supstanca nazvana merkaptoetanol kako bi se uklonile disulfidne veze kako bi protein postao linearan. Zatim se inicira elektroforeza. Rezultati bi dali dva ostatka molekula, od kojih je jedan SDS-PAGE.

Odsutnost SDS-PAGE nije problem jer se gel elektroforeza može učiniti samo da proteini ne gube svu sekundarnu i tercijarnu strukturu i ne otvaraju se u općenito ravne šipke.

U međuvremenu, nativna gel elektroforeza koristi gel kao antikonvekcijski medij. Obično se koristi za odvajanje bioloških makromolekula kao što su DNA, ribonukleinska kiselina (RNA) i proteini. Također se može koristiti za odvajanje nanočestica.

Dvije su glavne gelove korištene u nativnoj gel elektroforezi, i to:

Agarozni gel koji se koristi za veće molekule. Ovaj gel ne identificira male razlike između dviju molekularnih traka. Također se isključivo koristi za odvajanje DNA. Vizualizacija agaroznog gela obavlja se s mješavinom etidij bromida.

Poliakrilamidni gel koji se koristi za manje molekule. Ovaj gel identificira razlike između molekularnih vrpci. Osim DNK, ona također može odvojiti proteine.

Sažetak:

1.SDS-PAGE je neselektivna metoda gel elektroforeze koja se upotrebljava u poljima kao što su: biokemija, forenzika, biologija i genetika za odstranjivanje proteina iz njihove elektroforetske pokretljivosti, dok se gel elektroforeza obično koristi za odvajanje bioloških makromolekula kao što su DNA, ribonukleinska kiselina (RNA) i proteini. Također se može koristiti za odvajanje nanočestica.

2.Nativna gel elektroforeza ima dvije vrste, naime: agarozni gel i poliakrilamidni gel.